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Dipl.-Inf. Sebastian Grottel

Dr. rer. nat. Sebastian Grottel

Büro: VISUS-Gebäude

Universität Stuttgart
Allmandring 19
70569 Stuttgart

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Telefaxnummer: +49 (711) 685-88620

E-Mail-Adresse: Sebastian.Grottel@visus.uni-stuttgart.de

Der Schwerpunkt meiner Arbeit ist die Visualisierung von Partikeldatensätzen mit großen Teilchenzahlen, (z. B.: Daten aus der Molekulardynamik).

Um die direkte Visualisierung optimal zu beschleunigen werden Sichtbarkeitsanalysen und punktbasiertes Rendering auf programmierbaren Graphikkarten eingesetzt. Zur Steigerung der Effektivität werden abstrahierte Darstellungen mittels Feature-Extraktion erzeugt.

Aktuelle Projekte

Zum 31.3.2012 habe ich die Universität Stuttgart verlassen.

Details folgen.

SFB 716

DFG Sonderforschungsbereich 716: Dynamische Simulation von Systemen mit großen Teilchenzahlen
Webseite: http://www.sfb716.uni-stuttgart.de/

Teilprojekt D3: Visualisierung von Systemen mit großen Teilchenzahlen
Webseite: http://www.sfb716.uni-stuttgart.de/projekte/skalierbare-algorithmen-und-effiziente-implementierung/projekt-d3.html

Die Visualisierung und Analyse von Molekulardynamikdatensätzen der im SFB716 angestrebten Größenordnung erfordert neue Ansätze und Algorithmen. Langfristiges Ziel dieses Teilprojekts ist die Entwicklung von Methoden, die eine interaktive Exploration und aussagekräftige Repräsentation solcher zeitabhängigen Datensätze erlaubt.

MegaMol™

MegaMol™ ist der Nachfolger von MolCloud, ein an der Universität Stuttgart entwickeltes Visualisierungswerkzeug zur Darstellung von punktbasierten Moleküldatensätzen. Weitere Informationen befinden sich auf der MegaMol™-Projekt-Webseite.

MegaMol™ (V.: 0.4) Core-Quellcodedokumentation: Generiert durch Doxygen (Stand: 03.03.2011; Rev.: 262)

MegaMol™ (V.: 0.4) Console-Quellcodedokumentation: Generiert durch Doxygen (Stand: 03.03.2011; Rev.: 102)

VISlib™

Die VISlib™ ist eine an der Universität Stuttgart entwickelte Bibliothek von C++-Basisklassen zur Unterstützung der Entwicklung von Anwendungen für Microsoft Windows und Linux, mit besonderem Schwerpunkt auf Funktionalität für die wissenschaftliche Visualisierung.

Trac: https://vis-web.informatik.uni-stuttgart.de/trac/vislib

VISlib Quellcodedokumentation: Generiert durch Doxygen (Stand: 03.03.2011; Rev.: 1103)
Achtung: Viele Template-Klassen der VISlib™, insbesondere im Namespace math sind für Doxygen zu fantastic um die Vererbungshierarchie korrekt auflösen zu können.

Aktuelle Forschungsergebnisse

26.09.2011

Nach ausführlicher Diskussion haben wir herausgefunden: Lance HenriksenJohn Hurt

Publikationen

2017

Gralka, Patrick; Grottel, Sebastian; Staib, Joachim; Schatz, Karsten; Karch, Grzegorz K.; Hirschler, M.; Krone, Michael; Reina, Guido; Gumhold, S.; Ertl, Thomas: 2016 IEEE Scientific Visualization Contest Winner: Visual and Structural Analysis of Point-based Simulation Ensembles. In: IEEE Computer Graphics & Applications (2017) (Noch nicht erschienen).
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2016

Interactive GPU-based Visualization of Large Dynamic Particle Data
Falk, Martin; Grottel, Sebastian; Krone, Michael; Reina, Guido: Interactive GPU-based Visualization of Large Dynamic Particle Data. San Rafael, CA: Morgan & Claypool Publishers, 2016.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
MegaMol - for Fun and Profit
Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Krone, Michael; Müller, Christoph; Ertl, Thomas: MegaMol - for Fun and Profit. In: Workshop on Visualization in Practice, 2016.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]

2015

MegaMol – A Prototyping Framework for Particle-based Visualization
Grottel, Sebastian; Krone, Michael; Müller, Christoph; Reina, Guido; Ertl, Thomas: MegaMol – A Prototyping Framework for Particle-based Visualization. In: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics: Ausgabe 21, Nr. 2 (2015), S. 201-214.
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2014

Grottel, Sebastian; Heinrich, Julian; Weiskopf, Daniel; Gumhold, S.: Visual Analysis of Trajectories in Multi-Dimensional State Spaces. In: Computer Graphics Forum: Ausgabe 33, Nr. 6 (2014), S. 310–321.
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2013

Gralka, Patrick; Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Ertl, Thomas: Application-Specific Compression of Large MD Data Preserving Physical Characteristics. In: Proceedings of IEEE Symposium on Large-Scale Data Analysis and Visualization, S. 85-93, 2013.
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2012

GPU-Accelerated Visualization
Ament, Marco; Frey, Steffen; Müller, Christoph; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas; Weiskopf, Daniel: GPU-Accelerated Visualization. In: E. W. Bethel, H. Childs, and C. Hansen: High Performance Visualization: Enabling Extreme-Scale Scientific Insight. Chapman and Hall/CRC, 2012.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Object-Space Ambient Occlusion for Molecular Dynamics
Grottel, Sebastian; Krone, Michael; Scharnowski, Katrin; Ertl, Thomas: Object-Space Ambient Occlusion for Molecular Dynamics. In: Proceedings of IEEE Pacific Visualization Symposium 2012, S. 209-216, 2012.
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Point-based Visualization of Molecular Dynamics Data Sets
Grottel, Sebastian: Point-based Visualization of Molecular Dynamics Data Sets. Diss., Visualisierungsinstitut der Universität Stuttgart, 2012.
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2011

Loose Capacity-Constrained Representatives for the Qualitative Visual Analysis in Molecular Dynamics
Frey, Steffen; Schlömer, Thomas ; Grottel, Sebastian; Dachsbacher, Carsten; Deussen, Oliver; Ertl, Thomas: Loose Capacity-Constrained Representatives for the Qualitative Visual Analysis in Molecular Dynamics. In: Proceedings of the 2011 IEEE Pacific Visualization Symposium, S. 51-58, 2011.
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Parallel Contour-Buildup Algorithm for the Molecular Surface
Krone, Michael; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas: Parallel Contour-Buildup Algorithm for the Molecular Surface. In: Proceedings of IEEE Symposium on Biological Data Visualization (biovis'11), S. 17-22, 2011.
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2010

Special Relativistic Visualization by Local Ray Tracing
Müller, Thomas; Grottel, Sebastian; Weiskopf, Daniel: Special Relativistic Visualization by Local Ray Tracing. In: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics: Ausgabe 16, Nr. 6 (2010), S. 1243-1250.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Interactive Image-Space Volume Visualization for Dynamic Particle Simulations
Falk, Martin; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas: Interactive Image-Space Volume Visualization for Dynamic Particle Simulations. In: Proceedings of The Annual SIGRAD Conference, S. 35-43, 2010.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Coherent Culling and Shading for Large Molecular Dynamics Visualization
Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Dachsbacher, Carsten; Ertl, Thomas: Coherent Culling and Shading for Large Molecular Dynamics Visualization. In: Computer Graphics Forum (Proceedings of EUROVIS 2010), S. 953-962, 2010.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Particle-based Rendering for Porous Media.
Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Zauner, Thomas; Hilfer, Rudolf; Ertl, Thomas: Particle-based Rendering for Porous Media.. In: Proceedings of The Annual SIGRAD Conference, S. 45-51, 2010.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Vide: an editor for the visual exploration of raw data
Wörner, Michael; Reina, Guido; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas: Vide: an editor for the visual exploration of raw data. In: Visualization and Data Analysis (VDA 2010), 2010.
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2009

Topological Extraction and Tracking of Defects in Crystal Structures
Grottel, Sebastian; Dietrich, Carlos A.; Comba, João L. D.; Ertl, Thomas: Topological Extraction and Tracking of Defects in Crystal Structures. In: , S. 167-178, 2009.
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A Lean Process Model using In-House Source Code Libraries for Efficient Development of Visualization Applications
Grottel, Sebastian; Müller, Christoph; Reina, Guido; Ertl, Thomas: A Lean Process Model using In-House Source Code Libraries for Efficient Development of Visualization Applications. In: Workshop Refactoring Visualization from Experience '09, 2009.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Optimized Data Transfer for Time-dependent, GPU-based Glyphs.
Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Ertl, Thomas: Optimized Data Transfer for Time-dependent, GPU-based Glyphs.. In: Proceedings of IEEE Pacific Visualization Symposium 2009, S. 65-72, 2009.
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2008

Bidmon, Katrin; Grottel, Sebastian; Bös, Fabian; Pleiss, Jürgen; Ertl, Thomas: Visual Abstractions of Solvent Pathlines near Protein Cavities. In: Computer Graphics Forum (EuroVis 2008 Special Issue): Ausgabe 27, Nr. 3 (2008), S. 935-942.
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Lernen mit Web-basierten interaktiven Systemen
Grottel, Sebastian; Gunzenhäuser, Rul; Rotard, Martin; Taras, Christiane: Lernen mit Web-basierten interaktiven Systemen. In: Navigationen - Zeitschrift für Medien- und Kulturwissenschaften: Ausgabe 8, Nr. 1 (2008), S. 43-58.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]
Horsch, Martin; Vrabec, Jadran; Bernreuther, Martin; Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Wix, Andrea; Schaber, Karlheinz; Hasse, Hans: Homogeneous nucleation in supersaturated vapors of methane, ethane, and carbon dioxide predicted by brute force molecular dynamics. In: Journal of Chemical Physics: Ausgabe 128, Nr. 16 (2008), S. 164510.
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2007

Visual Verification and Analysis of Cluster Detection for Molecular Dynamics
Grottel, Sebastian; Reina, Guido; Vrabec, Jadran; Ertl, Thomas: Visual Verification and Analysis of Cluster Detection for Molecular Dynamics. In: Proceedings of IEEE Visualization '07, S. 1624-1631, 2007.
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Image-Space GPU Metaballs for Time-Dependent Particle Data Sets
Müller, Christoph; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas: Image-Space GPU Metaballs for Time-Dependent Particle Data Sets. In: Proceedings of VMV '07, S. 31-40, 2007.
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Image-Space GPU Metaballs for Time-Dependent Particle Data Sets
Müller, Christoph; Grottel, Sebastian; Ertl, Thomas: Image-Space GPU Metaballs for Time-Dependent Particle Data Sets. In: VMV 2007, S. 31-40, 2007.
[XPS] [PDF] [DOI] [OpenXML] [BibTeX] [Vortragsfolien] [Details]

Lehre

Diplomarbeiten

  • Visualisierung von Atomgitterfehlern (Arbeitsumfang variierbar, daher auch als Master-, Bachlor- oder Studienarbeit möglich)
  • Extraktion von möglichst regulären Isoflächen aus sehr großen Volumendatensätzen (Arbeitsumfang variierbar, daher auch als Master-, Bachlor- oder Studienarbeit möglich)
  • Erweiterter Hex-Editor mit Semantischen Linsen (beendet)
  • Datenstrukturen zur Speicherung zeitabhängiger Punktdatensätze zur Effizienten Out-Of-Core-Visualisierung (beendet)

Studienarbeiten

  • Partikelbasierte LOD-Visualisierung von Planetenringsystemen (beendet)
  • Interaktive Visualisierung der zeitlichen Entwicklung von Features in Molekülardynamicdatensätzen (beendet)

Studienprojekte

  • LaVida (WS 10/11, SS 11; beendet)
  • Stellarkartographie (WS 09/10, SS 10; beendet)
  • Subversion Statistics Sifter (WS 08/09, SS 09; beendet)
  • VISdʒets (WS 06/07, SS 07; beendet)
    Studentisches Projekt zur Entwicklung einer nativen GUI in OpenGL für Powerwallanwendungen (unchefmäßigerweise auch als VISdgets zu finden).

Softwarepraktika

  • Parallel Up-Scaling of Dynamic Low-Resolution Content (offen)
  • Stereo-Foto-Viewer (offen)
  • Stereo Viewer for 3D Objekte (beendet)
  • Spiel: Power Luna Lander 3D Turbo Champion Edition (beendet)
  • Steuerung einer 3D Figur mit einem Datenhandschuh (beendet)
  • Erstellung eines Maya-Plug-Ins zur Kopplung eines Rigs mit Motion-Capture-Daten (beendet)

Fachstudien

  • Fachstudie: Untersuchung von Ressourceneinbettung unter Linux (beendet)

Wintersemester 2011/12

Sommersemester 2011

  • Studienprojekt: LaVida

Wintersemester 2010/11

  • Studienprojekt: LaVida

Sommersemester 2010

  • Studienprojekt: Stellarkartographie

Wintersemester 2009/10

  • Studienprojekt: Stellarkartographie

Sommersemester 2009

  • Seminar: Algorithmen für Computerspiele
  • Studienprojekt: Subversion Statistics Sifter

Wintersemester 2008/09

  • Übung: Modellierung und Animation
  • Studienprojekt: Subversion Statistics Sifter

Wintersemester 2007/08

  • Übung: Modellierung und Animation
  • Grundlagen der Interaktiven Systeme

Sommersemester 2007

  • Studienprojekt: VISdʒets
  • Fachpraktikum: Graphik-Programmierung

Wintersemester 2006/07

  • Übung: Modellierung und Animation
  • Studienprojekt: VISdʒets

Sommersemester 2006

  • Fachpraktikum: Graphik-Programmierung

Beendete Projekte

Performance Peon

Der Performance Peon ist ein Tools zur Erfassung von ganzen Messreihen von Rendering-Performance-Werten zur Geschwindigkeitsanalyse von Visualisierungsanwendungen unter unterschiedlichen Bedingungen.

Die Webseite augenblicklich nicht verfügbar.

MolCloud

MolCloud ist ein an der Universität Stuttgart entwickeltes Visualisierungswerkzeug zur Darstellung von punktbasierten Moleküldatensätzen.
Zum Herbst 2006 wurde die Arbeit am Nachfolge-Projekt MegaMol™ begonnen. Gleichzeitig wurde die Weiterentwicklung von MolCloud gestoppt.

Zusätzliches

VIS-Abteilungs-Subversion-Server

Ich habe die ursprüngliche Fassung der Admin-Verwaltungswebseite für den Abteilungs-SVN-Server geschrieben.